實驗目的:尋找靶蛋白的互作蛋白
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服務簡介:
???????TAP/MS是Co-IP/MS的“近親”,兩者在尋找誘餌蛋白的互作蛋白以及純化互作蛋白的原理類似。不同的是TAP/MS引入了2個純化標簽(strep或SBP,flag),2步純化,能有效純化裂解液中的靶蛋白及其復合物,并使非特異性蛋白的數量降至較低水平。實驗組和對照組洗脫的蛋白分別做質譜,從實驗組結果中扣除對照組中的蛋白,即可鑒定出與靶蛋白互作的蛋白。
技術優勢:
? 1、TAP/MS鑒定到的互作蛋白是細胞內與誘餌蛋白天然互作的,符合體內真實生理情況,可信度高。
? 2、采用兩步純化,能有效減少非特異蛋白的結合。
服務內容:
? 1、構建Flag-strep(或Flag-SBP)雙標簽的靶基因表達載體;
? 2、包裝慢病毒感染目的細胞,做成過表達細胞株,WB檢測表達效果(基因大于2kb時,可能導致病毒滴度不足以感染細胞系,此時如需進行加藥篩選構建穩轉細胞系,則周期預計延長3-4周);
? 3、細胞總蛋白,經streptactin 樹脂(或strep磁珠)和anti-flag抗體兩步純化,并洗脫;
? 4、實驗組和對照組的洗脫液分別用胰酶酶解;
? 5、LC-MS/MS分析,獲得蛋白質的定量、定性信息;
? 6、實驗組結果扣除對照組中的蛋白,即可得到與靶蛋白互作的蛋白。
| 服務項目 | 客戶提供 | 結果交付 | 實驗周期 |
| TAP/MS | 1、誘餌基因的名稱、序列、物種等信息或者誘餌基因的cDNA模板等 2、待研究的細胞(保證細胞狀態良好)及其培養相關信息 | 1、構建好的慢病毒表達載體 2、穩轉細胞系(如做了篩選) 3、實驗組和對照組蛋白的質譜鑒定結果 4、數據分析結果 | 預計2.5-3個月 |
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